MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp28-2

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011779	TTTA	2	8	52	59	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011779	ATT	3	9	72	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011779	AT	3	6	86	91	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011779	AAT	2	6	105	110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011779	TAT	2	6	111	116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011779	AT	4	8	122	129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011779	AAAT	2	8	1093	1100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011779	TAAAT	2	10	1109	1118	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011779	ATA	3	9	1126	1134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011779	T	8	8	1141	1148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011779	CTA	2	6	1174	1179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011779	ATA	2	6	1189	1194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011779	G	6	6	1219	1224	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011779	AAT	2	6	1247	1252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011779	ATA	2	6	1276	1281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011779	TAA	2	6	1288	1293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011779	CAA	2	6	1294	1299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011779	ATT	2	6	1362	1367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011779	TA	3	6	1392	1397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011779	AAG	2	6	1399	1404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011779	GA	3	6	1419	1424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011779	A	6	6	1428	1433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011779	AAAT	2	8	1445	1452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011779	A	6	6	1482	1487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011779	AGA	2	6	1496	1501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011779	ATT	2	6	1587	1592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011779	GTT	2	6	1668	1673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011779	CAA	2	6	1675	1680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011779	AAAAC	2	10	1727	1736	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_011779	T	6	6	1753	1758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011779	AGA	2	6	1763	1768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011779	TTA	2	6	1804	1809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011779	ACTAT	2	10	1831	1840	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011779	ACTTA	2	10	1867	1876	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011779	AAG	2	6	1903	1908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011779	TCA	2	6	1927	1932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011779	A	7	7	1960	1966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011779	TAAA	2	8	2078	2085	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011779	ATT	2	6	2124	2129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011779	AGG	2	6	2130	2135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011779	TAATAT	2	12	2136	2147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011779	A	7	7	2149	2155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011779	ATTAAT	2	12	2163	2174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011779	TGGAG	2	10	2226	2235	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011779	TGG	3	9	2348	2356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011779	ACT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011779	GGAA	2	8	2382	2389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011779	AGG	2	6	2418	2423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011779	TAA	2	6	2456	2461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011779	GGA	2	6	2464	2469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011779	TAT	2	6	2471	2476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011779	AGG	2	6	2484	2489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011779	ATT	3	9	2521	2529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011779	A	7	7	2566	2572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011779	A	6	6	2644	2649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011779	ATT	2	6	2692	2697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011779	CT	3	6	2712	2717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011779	CTT	2	6	2728	2733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011779	ATT	2	6	2780	2785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011779	TAC	2	6	2795	2800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011779	TAT	2	6	2809	2814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011779	TTAAAT	2	12	2818	2829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011779	CTT	2	6	2887	2892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011779	ACT	2	6	3059	3064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011779	ACT	2	6	3116	3121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011779	TCTA	2	8	3146	3153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011779	TAA	2	6	3312	3317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011779	TCTTT	2	10	3336	3345	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_011779	T	6	6	3417	3422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011779	T	6	6	3440	3445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011779	T	6	6	3459	3464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011779	AATA	2	8	3465	3472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011779	GAT	2	6	3478	3483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011779	ACT	2	6	3500	3505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011779	TCT	2	6	3546	3551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011779	ATC	2	6	3620	3625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011779	CTA	3	9	3637	3645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011779	T	7	7	3746	3752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011779	ATT	2	6	3754	3759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011779	T	6	6	3823	3828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011779	A	7	7	3838	3844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011779	A	6	6	3908	3913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011779	TTC	2	6	3919	3924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011779	TAA	2	6	3945	3950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011779	ATT	2	6	3961	3966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011779	TAA	2	6	3971	3976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011779	TCTT	2	8	3977	3984	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011779	T	8	8	4042	4049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011779	AT	3	6	4063	4068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011779	TTA	2	6	4085	4090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011779	ATT	2	6	4097	4102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011779	T	6	6	4101	4106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011779	ATATT	2	10	4116	4125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011779	A	6	6	4163	4168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011779	A	6	6	4253	4258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011779	A	6	6	4274	4279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011779	TA	4	8	4288	4295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011779	T	9	9	6726	6734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011779	A	7	7	6735	6741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011779	T	6	6	6757	6762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011779	AG	3	6	6763	6768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011779	TA	3	6	7354	7359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011779	AAAAGA	2	12	7384	7395	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011779	ATA	2	6	7441	7446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011779	TATCAA	2	12	7457	7468	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_011779	TAT	2	6	7469	7474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011779	A	6	6	7480	7485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011779	T	6	6	7511	7516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011779	ATT	3	9	10800	10808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011779	TCA	2	6	10809	10814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011779	T	9	9	11075	11083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011779	CCT	2	6	14391	14396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_011779	T	6	6	14398	14403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011779	CCT	2	6	15480	15485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_011779	AAATT	2	10	15488	15497	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011779	AG	3	6	18758	18763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011779	TATTT	2	10	18784	18793	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011779	T	6	6	18836	18841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011779	TTG	2	6	18856	18861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011779	T	7	7	24164	24170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011779	A	7	7	24179	24185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011779	T	6	6	24200	24205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011779	A	6	6	24206	24211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011779	TAAA	2	8	24212	24219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011779	CTAG	2	8	24227	24234	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011779	CAA	2	6	24261	24266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011779	ATT	2	6	24282	24287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011779	A	6	6	24326	24331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011779	T	6	6	24339	24344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011779	T	7	7	24348	24354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011779	A	6	6	24360	24365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011779	AT	3	6	24375	24380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011779	T	6	6	24405	24410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011779	A	9	9	24425	24433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011779	TGCA	2	8	24464	24471	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011779	AGG	2	6	26013	26018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011779	ATA	2	6	26449	26454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011779	AGG	2	6	26455	26460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011779	GTT	2	6	26517	26522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011779	CAG	2	6	26535	26540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011779	T	7	7	26561	26567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011779	ATT	2	6	26577	26582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011779	TGA	2	6	26611	26616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011779	AG	3	6	26684	26689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011779	TAG	2	6	28057	28062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011779	TA	3	6	29616	29621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011779	T	6	6	29623	29628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011779	AAG	2	6	29642	29647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.